กระทรวงยุติธรรม (ญี่ปุ่น: 法務省 โรมาจิ: Hōmusho) เป็นกระทรวงที่ระดับคณะรัฐมนตรีในรัฐบาลญี่ปุ่น มีอำนาจหน้าที่เกี่ยวข้องกับระบบตุลาการ การให้บริการด้านราชทัณฑ์ และการจดทะเบียนครัวเรือน ทรัพย์สิน และบรรษัท นอกจากนี้ยังเป็นผู้แทนตามกฎหมายของรัฐบาลกระทรวงยุติธรรมตั้งขึ้นใน ค.ศ. 1871 ในชื่อ กระทรวงตุลาการ (ญี่ปุ่น: 司法省 โรมาจิ: Shihōsho)[1] ชื่อในปัจจุบันได้รับมาจากรัฐธรรมนูญแห่งญี่ปุ่นช่วงหลังสงครามโลกครั้งที่สองใน ค.ศ. 1952 มีอำนาจหน้าที่บริหารระบบตุลาการและระบบการลงโทษในญี่ปุ่น นอกจากนี้ยังเป็นตัวแทนของรัฐบาลญี่ปุ่นในการฟ้องร้องคดี อีกทั้งยังมีหน้าที่ในการจดทะเบียนครัวเรือน คนต่างด้าวที่พำนักในประเทศ อสังหาริมทรัพย์ และบรรษัท